Стаття від: 20 вересня 2023 року
Зразок набору eForesee
Найсучасніший нагляд ДНК може перевершити поточні підходи до діагностики
Аквакультура перебуває під тиском. Минулорічне дослідження виробництва лосося показало, що, незважаючи на незначне зростання обсягів виробництва у 2021 році, загальна тенденція до зниження виживання риби 2-го року життя зберігається. Це тривожне падіння стану здоров’я риби також призводить до економічних втрат.
Смертність трапляється, коли тварини піддаються стресу, спричиненому дисбалансом у їхньому фізичному, хімічному та біологічному середовищі. Це можна регулярно відстежувати за допомогою віддаленого доступу до даних. Аналогічно, метеорологічний моніторинг є звичним і безперешкодним. Нові компанії навіть пропонують послуги з моніторингу стресу за допомогою маркерів крові.
Однак ми все більше усвідомлюємо роль, яку відіграє біологічне середовище у виникненні хвороб. Метагеноміка, дослідження всієї генетичної інформації, що міститься в екосистемі, має потенціал відкрити світ таємниць, ключ до підтримки добробуту тварин і зниження смертності.
Сьомга
Усі тварини сприйнятливі до інфекцій, і водні види не є винятком. З розвитком аквакультури зростає і кількість тварин, які живуть у безпосередній близькості, за неприродної щільності, що збільшує ймовірність поширення хвороб.
Патогени – це хвороботворні організми. Багато з них стали сумнозвісними в аквакультурі: Flavobacterium psychrophilum, Yersinia ruckerii, Neoparamoeba perurans і Tetracapsuloides bryosalmonae – всі ці назви добре знайомі. Однак вони поширені повсюдно і не існують ізольовано, утворюючи складні мікробні спільноти, відомі як мікробіоми. Тварини постійно піддаються впливу мінливих популяцій цієї потенційно хвороботворної суміші.
Традиційні методи діагностики, включаючи молекулярні та гістологічні методи, можуть бути використані для підтвердження збудника і визначення лікування, але вони дають лише оперативне уявлення про хворобу, як тільки вона з’являється. На жаль, багато мікробів залишаються неохарактеризованими і погано описаними.
Що, якби ми могли бачити червоні прапорці на ранній стадії, виявляти нові патогени, прогнозувати сезонні спалахи та ідентифікувати гени опірності до антибіотиків? Не дивно, що зараз галузь шукає рішення, які дозволять передбачати захворювання, формувати стратегії лікування і робити це з запасом часу. Боротьба з інфекційними захворюваннями – це та сфера, де галузь зараз найбільше прагне інновацій.
Робочий процес Esox (1- збирання зразків; 2- екстракція ДНК; 3- секвенування; 4- біоінформатика)
Метагеноміка увійшла в цю сферу, принісши з собою можливість моніторингу всіх мікробіомів. Вона використовує секвенування ДНК наступного покоління і складні біоінформаційні методи для ідентифікації організмів за їхнім унікальним генетичним кодом. Він може точно виявляти патогени високого рівня ризику поряд з їхніми раніше невідомими аналогами. Поступово можна створювати бази даних охарактеризованих видів і розкривати тонкощі популяційної динаміки мікробіомів.
Ефективні стратегії профілактики захворювань можливі лише за умови глибокого знання умов, що їх спричиняють. Усі інфекційні захворювання мають патогенного винуватця, як правило, мікробної природи. Метагеноміка зараз розкриває генетичну та молекулярну архітектуру всіх мікроорганізмів, що мешкають у водному середовищі, вивчаючи їхні взаємини між собою та тваринами, яких вони заражають.
Використовуючи ці революційні знання про водні мікробіоми, Esox Biologics відкриває нову еру точної діагностики, виявляючи згубні зміни в мікробних популяціях задовго до появи патології та клінічних симптомів. Метагеноміка пропонує спосіб контролювати ризик захворювань, інформувати про стратегії лікування та захищати здоров’я рибницьких господарств.
Якщо ви хочете дізнатися більше або безкоштовно випробувати нашу послугу, зв’яжіться з нашим менеджером по продуктах, Ben Mackrow at benmackrow@esoxbio.com
